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Para entender las entidades biológicas a nivel de sistemas, es importante analizar el conjunto de sus interacciones - la red - de moléculas en la célula. Similitudes funcionales e innovaciones pueden ser reveladas mediante comparaciones de redes de regulación entre diferentes especies. Para comparar redes, estas puedes ser alineadas, lo que es conceptualmente similar a alineamientos de secuencias génicas y de estructuras moleculares. La incorporación del estudio de redes en biología evolutiva es un campo de investigación relativamente nuevo, y ya que es matemáticamente y computacionalmente intenso, pareciera aún inaccesible a muchos investigadores de la biología. Nosotros creemos que es un tema importante y que hará un gran impacto en un futuro muy próximo.

En este curso nos enfocaremos en redes de regulación de genes. Estas redes pueden ser mapeadas a grafos dirigidos donde los nodos representan genes regulados y reguladores (que codifican para factores de transcripción). A fin de establecer una terminología común, comenzaremos este curso con una revisión de los conceptos y definiciones básicas de grafos dirigidos, tales como grados, caminos, circuitos, motivos, componentes fuertemente conexos, componentes disconexos, etc. A partir de esto, se mostrarán métodos computacionales para la comparación de redes.

En la parte práctica de este curso, se implementarán algunos algoritmos en Python y otros que ya se conocen serán adaptados para trabajar con datos de redes. Se comenzará con ejemplos sencillos obtenidos de datos biológicos y se compararán diferentes algoritmos con respecto a las redes con las que se esté trabajando. Las nociones de Python necesarias para llevar a cabo los ejercicios planteados se cubrirán también en el curso.

La biología evolutiva surgió del deseo de entender el origen y la diversificación de las formas de los organismos. En los últimos 150 años, estudiar estos aspectos de la evolución ha devenido en un campo de investigación científica; la respuesta clásica, encapsulada en el dogma del Darwinismo, es por "variaciones de los rasgos" y "selección natural". La versión moderna de este dogma sostiene que la continua modificación y herencia del patrimonio genético ha generado los planos para las formas de todos los organismos encontrados en la naturaleza.

El dogma Darwinista responde (parcialmente) a una sola de las dos preguntas iniciales: ¿cómo se diversifica la vida? Sin embargo, ha también alejado la investigación en biología evolutiva de la otra pregunta inicial: ¿cómo se originan las formas y las estructuras de los organismos? La pregunta de por qué y cómo ciertas formas aparecen en la evolución de los organismos no debe ser confundida con la pregunta de cómo las misma formas son mantenidas y variadas a través de las generaciones. En otras palabras, la selección natural puede funcionar solamente sobre lo que ya existe.

Este curso principiará con una serie de evidencias experimentales y preguntas que no encuentran una explicación directa en el dogma Darwinista. Una de estas preguntas es la siguiente: "¿Cómo sucedió la transición entre organismos unicelulares y multicelulares?" En la segunda parte del curso usaremos la teoría de sistemas dinámicos para dar una respuesta a esta fundamental pregunta de la biología evolutiva.

En esta platica se dará un recorrido por algunos trabajos, realizados en colaboración con mas investigadores(as), en los cuales se involucra el estudio de objetos matemáticos conocidos como grafos. Ciertas propiedades topológicas y dinámicas de estos resultan útiles para entender determinados fenómenos en la naturaleza.

El microbioma humano ha recibido significante atención en contextos médicos, de investigación y medios noticieros. Frecuentemente se dice que las bacterias simbióticas comensales ayudan al cuerpo a digerir alimentos y a proteger contra la colonización de organismos patógenos. Aunque los efectos positivos son indiscutibles, los mecanismos de acción no se conocen. Por ejemplo, hasta recientemente había sido difícil determinar la variedad de especies bacterianas dentro de organismos. Aún en la actualidad no es fácil distinguir procesos demográficos (crecimiento, migración y muerte) entre diferentes poblaciones bacterianas dentro del mismo organismo. Distinguir estos procesos es importante, ya que puede ayudar a determinar el mejor tratamiento para promover bacterias comensales y eliminar patógenos. Nuevos avances en tecnología molecular, colaboraciones interdisciplinarias entre especialistas en microbiología molecular, ecología evolutiva y matemáticas, ahora permiten descifrar la vida bacteriana dentro de varios organismos. El objetivo principal de mi plática es describir las técnicas moleculares y experimentales que he desarrollado para estudiar la interacción entre bacterias comensales y patogénicas de organismos. En la segunda parte presentaré brevemente un ejemplo reciente del uso de secuenciaciones de nueva generación (Next Gen. Seq.) para monitorear brotes epidémicos en Latinoamérica. En particular me enfocaré en la importancia de desarrollar conocimiento científico para promover su aplicación a problemas actuales.

A pesar de la relevancia de la estructura espacio-temporal en las interacciones ecológicas de comunidades microbianas, nuestro entendimiento de los procesos que rigen la dinámica de una población de bacterias están, en general, fundamentados bajo la premisa de que la distribución espacial de recursos y de alelos en la población es uniforme y , por consiguiente, en presencia de un recurso limitante se sostiene el principio de exclusividad competitiva y sólo un genotipo persiste a largo plazo. Pero los ambientes naturales, como son los suelos y el cuerpo humano, son inherentemente heterogéneos y, por consiguiente, producen un mosaico dinámico de presiones selectivas que, a su vez, permite la coexistencia de múltiples tipos celulares en consorcios bacterianos complejos.

En esta plática, desde un punto de vista interdisciplinario, utilizando modelos matemáticos y experimentos *in vitro* me enfocaré en discutir como la dinámica temporal es importante para el diseño de protocolos de uso de antibióticos para minimizar la aparición de resistencia en ambientes homogéneos y posibles estrategias para evaluar el efecto de la estructura espacial en los perfiles dinámicos de resistencia y diversidad en poblaciones bacterianas mixtas.

La organización tridimensional del genoma al interior del núcleo celular no es aleatoria. Los cromosomas ocupan territorios discretos al interior del espacio nuclear, existen compartimentos topológicos en la escala de megabases así como dominios en la escala de cientos de kilobases y existen asas de cromatina que conectan a los genes con sus elementos de regulación. En la última década se han desarrollado un grupo de técnicas moleculares basadas en medir la frecuencia de ligación entre moléculas próximas de DNA y su secuenciación masiva, que han permitido explorar la organización espacial del genoma a una resolución sin precedentes. En esta charla discutiré el tipo de datos que se generan a partir de las técnicas ´C´ y mostraré resultados obtenidos al estudiar el interactoma de promotores del genoma pluripotente.

En esta charla describiremos algunas de las características observadas, así como patrones encontrados en grabaciones clínicas de actividad cerebral durante tareas de percepción temporal.

Los plásmidos (moléculas de ADN que se replican independientemente del cromosoma) son centrales para la evolución microbiana puesto que permiten la propagación horizontal de genes entre cepas bacterianas. Sin embargo, debido al costo metabólico que imponen a sus huéspedes y a la posibilidad de perderse durante la división celular, es difícil entender cómo pueden persistir establemente en poblaciones de bacterias cuando no portan genes que aumenten la aptitud de la población a las condiciones ambientales. Resultados teóricos previos han argumentado que la solución a esta aparente paradoja es que la tasa de transferencia horizontal tiene que compensar a la tasa de pérdida por segregación y y al costo de portar el plásmido. Pero estudios genómicos recientes han identificado una gran cantidad de plásmidos que no poseen la capacidad de transferirse horizontalmente. En esta plática analizaremos los modelos matemáticos propuestos anteriormente y discutiremos sus limitaciones. Posteriormente, combinaremos modelos teóricos y experimentales para estudiar los procesos genéticos y metabólicos que incrementan la estabilidad de un plásmido multicopia y no-conjugativo en ausencia de presión selectiva. Finalmente, discutiremos predicciones teóricas que sugieren que los plásmidos multicopia pueden actuar como un mecanismo adaptativo que permitiría a poblaciones bacterianas adaptarse a medios ambientes hostiles e impredecibles.

Some years ago, only the portions of the chromosomes coding to proteins were considered important for the cellular mechanisms. Nowadays, other regions have been more carefully investigated. In particular, latest research definitely shows that RNAs that do not directly participate in protein synthesis, called non-coding RNAs (ncRNAs), play very important roles in the cell. Although specific laboratory and computational techniques together with thousands of ncRNA families are already known, there are no widely accepted methods to identify and classify ncRNAs, or to determine new characteristics of these molecules. In this talk, the objective is to discuss the computational methods: energy minimization; covariance models; machine learning; and multiagent system, to study ncRNAs. Furthermore, we indicate interesting topics of research in this area.

Las células excitables producen pulsos eléctricos (potenciales de acción) que facilitan distintas funciones de coordinación, secreción de moléculas de señalización, transferencia de información, cómputo nervioso, producción de fuerza, etc. El comportamiento de células excitables de distintos tipos se puede estudiar mediante modelos genéricos de transporte transmembranal de iones derivados a partir de principios fundamentales de termodinámica. De hecho, es fácil demostrar que el modelo basado en conductancia usado ampliamente para modelar excitabilidad celular es una aproximación lineal del modelo genérico mencionado anteriormente. La naturaleza biofísica de dichos modelos y su relación tan cercana con los datos obtenidos experimentalmente permite abordar preguntas de interés en fisiología sobre fenómenos que involucran distintos niveles de organización fisiológica. Por ejemplo, si los patrones de expresión de proteínas involucradas en la producción de pulsos eléctricos en una célula excitable cambian, ¿cuál es el efecto de dichos cambios en los mecanismos detrás de la producción de potenciales de acción? Hablaremos de fenómenos relacionados y parte de la plática se enfocará en ilustrar con ejemplos específicos la relación entre estructura de bifurcación en los modelos mencionados arriba, los patrones de expresión de canales iónicos (mediadores de corrientes transmembranales) y distintas dinámicas de potencial de membrana observadas experimentalmente.

Si el tiempo lo permite, hablaremos de extensiones de dichos modelos a nivel de microcircuitos nerviosos que incluyen aleatoridad y plasticidad sináptica.

En la plática se expondrá un resultado que da condiciones necesarias sobre los parámetros para la existencia de al menos un ciclo límite en un modelo matemático que describe la interaccón de tres poblaciones: polinizadores, planta y herbívoros. La interacción entre las dos primeras es de tipo mutualista y la da una respuesta funcional de Holling tipo II; mientras que la correspondiente a las segundas dos --- desde el punto de vista demográfico--- puede ser vista como de tipo presa-depredador y la describe una respuesta funcional de Holling tipo IV. Las técnicas mediante las cuales se demuestra el resultado provienen de sistemas dinámicos (bifurcación de Hopf, exponentes de Lyapunov). El resultado se ilustra con varias simulaciones numéricas.

Infecciones hospitalarias son aquellas relacionadas con servicios de salud, en general inducidas por malas condiciones de higiene y prácticas arriesgadas. Esas infecciones son una realidad mundial y causan un gran impacto económico para las instituiciones de salud, porque el tiempo de hospitalización de los pacientes puede extenderse.

La transmisión de las infecciones hospitalarias puede ocurrir entre los hospitales como resultado de la transferencia de pacientes. Por lo tanto, nuestro objetivo es proponer un modelo de redes complejas para describir la transmisión de una infección hospitalar entre los hospitales brasileños.

La red fue creada a partir de la geocodificación de los hospitales brasileños usando el ArcGIS. Los datos fueron consultados a través del sitio web del ministerio de salud, y fueron recolectados entre enero y marzo de 2016. Nosotros calculamos las distancias entre los hospitales y las usamos para contruir una red basada también en los tamaños de elllos. Obtenos algunas caracterizaciones estadísticas de la red, como el histograma, el “Cluster Spectrum” y la correlación de grado. Al final, proponenos un modelo estocástico para representar la transmisión de la infección en la red. Esa es basada en el número de camas disponibles en los hospitales y también en la matriz adjunta de la red.

Resultados preliminares serán presentados y discutidos.

Anteriormente se creía que la mayor parte del ADN era "basura" debido a que sólo el 1.2% del genoma humano codifica para proteínas, sin embargo, cerca del 90% se transcribe, lo que despertó la hipótesis de que existen muchas secuencias de ARN codificadas en el ADN cuya función no es traducirse en proteínas, sino algo más. Ésta hipótesis se ha confirmado en la última década con el descubrimiento de las funciones catalíticas, regulatorias y enzimáticas del ARN, por lo que se comenzó a definir el término de gen de ARN: una porción de ADN que codifica no para proteínas, sino para una cadena de ARN. Este trabajo propone el desarrollo de un clasificador de genes ARNnc apoyado por las características presentes en las estructuras secundarias representativas de las familias de ARNnc.

(Tesina de maestría bajo la dirección de la Dra. Natalia Bárbara Mantilla Beniers) La tos ferina es una enfermedad bacteriana causada por el agente Bordetella pertussis que afecta las vías respiratorias, es altamente contagiosa y ocasiona una tos violenta e incontrolable con dificultades para respirar. Existen antibióticos, como la eritromicina, que pueden hacer desaparecer los síntomas de forma más rápida si se inicia un tratamiento a tiempo. Desafortunadamente la mayoría de los pacientes reciben el diagnóstico demasiado tarde y los antibióticos no son muy efectivos. Sin embargo, los medicamentos pueden ayudar a reducir la capacidad del paciente para transmitir la enfermedad. En casos graves la tos ferina puede ser causa de muerte. El desarrollo de una vacuna junto con una exhaustiva campaña de vacunación entre 1940 y 1950 ayudó a controlar la enfermedad en distintas regiones del mundo, sin embargo, después de algunas décadas (aprox. 1990) se observó la reaparición de brotes,

En México, una alta proporción de muertes son causadas por enfermedades de origen epitelial, como los carcinomas, el asma, la dermatitis atópica, y las infecciones de mucosas. Para mejorar las estrategias preventivas y los tratamientos de estas enfermedades, es necesario un mejor entendimiento de los factores que las desencadenan. Debido a que se trata de enfermedades complejas en las que diferentes combinaciones de factores genéticos y ambientales pueden desencadenar la progresión de la enfermedad, y en donde puede existir un empeoramiento gradual de los síntomas, es necesario un enfoque sistémico y dinámico de estas patologías. En este sentido, hemos propuesto varios modelos matemáticos que nos han permitido integrar y analizar datos clínicos y experimentales, detectar de manera sistemática posibles causas de estas enfermedades, y proponer estrategias preventivas más eficientes.

Se estima que 1-3% de la población general padece de alguna forma de epilepsia, término que engloba a diversos desórdenes neurológicos donde se presentan crisis, las cuales se definen como la actividad sincrónica anormal del cerebro. De las epilepsias que tienen crisis cuyo origen está localizado en una estructura específica, la epilepsia del lóbulo temporal (ELT) es la más común. Por su origen puede ser clasificada en ELT izquierda o derecha y cada una presenta patrones diferentes de propagación del daño estructural. La presencia continua de crisis genera un deterioro que se extiende fuera del lóbulo temporal afectado, a través de las fibras de sustancia blanca que interconectan diferentes áreas del cerebro con el lóbulo temporal. Este daño se puede prevenir con tratamiento adecuado cuando se tiene un diagnóstico específico, sin embargo, el diagnóstico puede llegar a ser elusivo. Las imágenes de Resonancia Magnética (IRM) se han utilizado para diagnosticar la ELT y evaluar el estado de diversas estructuras del cerebro, en particular de los hipocampos, que son el sitio más afectado en la ELT. La IRM permite inferir la integridad del tejido cerebral de una manera no invasiva y cuantitativa. Aunque la mayor parte de los estudios de IRM se han enfocado a estructuras específicas de la ELT, se han descrito múltiples alteraciones tanto de substancia gris como blanca más allá del lóbulo temporal afectado, por lo que en este estudio evaluamos con IRM 121 regiones de interés (ROI) que corresponden a estructuras cerebrales definidas anatómicamente y representan la totalidad del cerebro. Nuestro objetivo fue evaluar de manera cuantitativa las estructuras cerebrales por medio de las ROI seleccionadas y estimar la relación entre ellas por medio de una matriz de correlaciones, para posteriormente determinar dónde radican las principales diferencias en los pacientes respecto a los sujetos sanos. Esto con el fin de esclarecer los conjuntos de estructuras que se afectan diferencialmente por grupo.

Presentaré, a través de distintos enfoques de modelación, tres perspectivas acerca del comportamiento de la biodiversidad en paisajes fragmentados por actividades agrícolas: en el modelo clásico de metapoblaciones, la razón entre extinción y colonización compensa la pérdida de hábitat; en un modelo dinámico discreto, un parche de hábitat experimenta extinciones recurrentes cuando aumenta la calidad del paisaje a su alrededor; por último, incorporar explícitamente el espacio y la dinámica de poblaciones en un modelo computacional permite comparar estrategias de conservación. Apoyaré mi charla en simulaciones realizadas en la aplicación Jupyter Notebook, con lo cual espero brindar ideas para utilizar la exploración interactiva de modelos como puente entre disciplinas.

Anaerobic digestion (AD) is a complex process in which organic matter is degraded by microorganisms producing biogas. This process has been applied for the treatment of a wide range of wastes, such as agricultural wastes, animal manures and industrial, municipal and domestic wastewater. The development of AD provides an attractive technique for organic matter removal and a source of renewable energy by biogas. The use of biodgesters for the treatment of animal manures by AD has increased over the past 70 years and have been expanded around the world. In this process, complex molecules such as polysaccharides are degraded in three and / or four main stages which are hydrolysis and / or fermentation, acetogenesis and finally methanogenesis. The microbial communities and their interactions play an essential role in the methane production. Nevertheless, the communities from anaerobic manure digesters have not yet been precisely characterized and this process is still considered a "black box". The knowledge of the phylogenetic relationships and the metabolic properties of these microorganisms is essential to understand the microbial interactions and the influence of the community structure at different points (influent, beginning, middle, final and effluent) of horizontal lagoon type biodigester fed with cattle manure. Sequences of 16S rRNA of bacterial population derived from 454 pyrosequencing of samples were analyzed by QIIME software to obtain their relative abundance. Adjacent matrices were developed based on the abundance of each group and microbial relationships were inferred according to an association network.

Los animales sociales requieren coordinar sus actividades a través de la toma de decisiones para poder acceder a los beneficios de la vida en grupo. Este proceso es complejo en las sociedades con una alta dinámica de fisión-fusión debido a la variación en tamaño y composición de los subgrupos que las constituyen. Comprender los principios fundamentales de las decisiones colectivas requiere determinar quién toma las decisiones y qué factores intervienen. Evaluamos el efecto de las características individuales y la información acerca de los sitios de alimentación en los movimientos colectivos de forrajeo de un grupo de monos araña en Punta Laguna, Yucatán, en 2015 y 2016. Se registraron 652 movimientos colectivos de forrajeo. Hubo diferencias significativas respecto a la proporción del tiempo en que los individuos van al frente del subgrupo durante los movimientos colectivos que inician. La decisión de iniciación fue parcialmente compartida, con los adultos iniciando movimientos más frecuentemente que los individuos subadultos y juveniles. Resalta el papel como iniciadores de algunos individuos adultos de mayor residencia en la zona y cuyos valores de centralidad por intermediación en la red de iniciación-seguimiento también son los más altos para el grupo. No observamos diferencias significativas en las tasas de iniciación entre sexos, ni en la frecuencia de transmisión y recepción de información entre edades y sexos. Hacen falta más análisis para determinar si la coordinación de los movimientos colectivos entre los sitios de alimentación puede surgir como un efecto del acceso a la información entre los individuos o de las relaciones entre ellos.

El cáncer de mama es una enfermedad heterogénea, y se define como un grupo de tumores epiteliales malignos caracterizados por la invasión del tejido adyacente con una tendencia a formar metastasis. Cómo el cáncer más frecuente en mujeres a nivel mundial, el cáncer de mamá es un problema de salud pública. Grandes esfuerzos de investigación han demostrado que diferentes especies de RNAs pequeños, dentro de los que destacan los micro-RNAs (miRNAS), están relacionadas a las alteraciones transcripcionales características de esta enfermedad. Sin embargo la forma en la que los miRNAs participan en el establecimiento, progresión y diseminación del cáncer de mama aún no se entiende por completo. Para entender el papel de los miRNAs en la regulación del cáncer de mama construimos una red de regulación transcripcional miRNA - RNA mensajero con datos de secuenciación de 86 pacientes del consorcio TCGA. Encontramos que la mayoría de los nodos y las interacciones forman parte de un 'componente conectado gigante'. Además el número de conexiones de los nodos (grado) es diferente entre las redes de casos y controles, aún así en ambos casos los nodos con los grados más altos son miRNAs. Decidimos estudiar dichos miRNAs con los grados más altos para cada caso como familias debido a la relación estructural que mantienen, y encontramos que para los casos la familia de miRNAs con grado más alto es mir-199, y mir-200 para los controles. Construimos subredes con los mensajeros y miRNAs que tienen interacciones directas con los miRNAs pertenecientes a cada familia en cada red, y encontramos que la mayoría de los miRNAs y los mensajeros presentes se han asociado a la transición epitelio-mesenquima y el desarrollo, como son: ZEB-1/2, TWIST-1/2, SNAI-2 y TGFBR2.

La infección del virus de papiloma humano (VPH) en el epitelio del cuello uterino ha sido identificado como el principal factor etiológico para el desarrollo del cáncer cervicouterino (CC). Este hallazgo ha propiciado el desarrollo de vacunas que ayudan a prevenir la infección por VPH 16 y 18. Ambos genotipos asociados con el 70% de los casos de CC en el mundo. En el presente estudio, se formuló un modelo, para determinar la emergencia de infección por VPHs de alto riesgo que no están incluidos en la vacuna. Las simulaciones númericas sugieren la presencia del fenómeno biológico de reemplazo de cepa patógena inducida por la vacuna, similar a otros casos ya reportados. En el presente estudio, proponemos el siguiente mecanismo de reemplazo: si la efectividad de la inmunidad cruzada es menor que la efectividad de la vacuna, entonces aumenta la infección por los genotipos de alto riesgo, no blancos de la vacuna. En este escenario, proponemos el desarrollo y aplicación de una segunda generación de vacunas de amplio espectro para cubrir las infecciones por VPHs de alto riesgo, no cubiertas en las actuales vacunas.

La formación de patrones de tricomas en la epidermis de hoja de Arabidopsis thaliana representa un buen modelo para estudiar la diferenciación celular y la formación de patrones. Los modelos dinámicos de Redes de Regulación Genética (RRG) y la evidencia experimental sugieren que la formación de patrones en este sistema es sensible a una gran variedad de señales y procesos a diferentes niveles. Por ejemplo, se ha observado que en la epidermis de hoja, las hormonas vegetales Giberelinas y Citoquininas promueven el desarrollo de tricomas, lo cual puede ocasionar cambios en la densidad y el patrón de distribución de éstos durante el desarrollo de la planta. Además, se ha visto que señales ambientales como el estrés y la herbivoría también pueden causar cambios en la distribución y densidad de los tricomas. En este trabajo nos propusimos integrar el papel de los mecanismos genéticos y hormonales en la formación y el desarrollo de tricomas en la epidermis de hoja de Arabidopsis thaliana.

El modelo presa depredador tipo Lotka-Volterra y el modelo epidémico tipo SIR sin dinámica vital presentan primeras integrales. Esta es una propiedad no muy común en modelos biomatemáticos. En este trabajo derivamos una primera integral, H(x,y,v), en un modelo para infecciones virales in vitro, que incorpora el efecto de absorción de la partícula viral durante el proceso de infección. El sistema tiene tres variables: células susceptibles, células infectadas y partículas virales libres. La primera integral nos conduce una tener una ecuación de cantidades conservadas de la infección viral en el cultivo celular. Realizamos algunas implementaciones numéricas con datos de una infección in vitro para mostrar los resultados.

El modelo presa depredador tipo Lotka-Volterra y el modelo epidémico tipo SIR sin dinámica vital presentan primeras integrales. Esta es una propiedad no muy común en modelos biomatemáticos. En este trabajo derivamos una primera integral, H(x,y,v), en un modelo para infecciones virales in vitro, que incorpora el efecto de absorción de la partícula viral durante el proceso de infección. El sistema tiene tres variables: células susceptibles, células infectadas y partículas virales libres. La primera integral nos conduce una tener una ecuación de cantidades conservadas de la infección viral en el cultivo celular. Realizamos algunas implementaciones numéricas con datos de una infección in vitro para mostrar los resultados.

Además del cromosoma, las bacterias pueden poseer material genético adicional en moléculas de ADN físicamente separadas del cromosoma que se replican independientemente. A estas moléculas se les denomina plásmidos y han sido ampliamente estudiados debido a que son una gran herramienta para la manipulación genética, pero también porque pueden contener genes que confieren a las bacterias funciones adicionales, por ejemplo de resistencia a antibióticos. La mayor parte de los estudios previos se enfocan en analizar el fenómeno de transferencia horizontal de genes utilizando plásmidos como vectores, mediante un proceso conocido como conjugación. Pero, en la naturaleza, existen una gran cantidad de plásmidos no-conjugativos, lo que nos lleva a realizar cuestionamientos fundamentales acerca del beneficio funcional de portar plásmidos, en particular cuando estos carecen de la maquinaria molecular que les permite transferirse horizontalmente. En esta plática nos enfocaremos en analizar l

Las redes complejas muestran robustez contra fallas que ocurran al azar en sus componentes, pero son frágiles contra ataques dirigidos. En el presente estudio, analizamos el comportamiento de líneas celulares de humano y ratón contra fallas y ataques. El estado regulatorio celular está estructuralmente representado por redes de factores de transcripción específicas de tipo celular generadas a partir de datos de accesibilidad a cromatina. La caracterización y comparación de los diferentes tipos celulares, muestra una propiedad estructural subyacente a las células troncales embrionarias: la heterogeneidad de su red regulatoria les brinda una alta robustez contra errores y ataques dirigidos. Esta característica permite especular sobre posibles implicaciones biológicas en el estado troncal.

En este trabajo se estudia la influencia del crecimiento de la población de Micobacterium tuberculosis en la prevalencia de la infección. Para este fin se formula un modelo suponiendo que el bacilo presenta dos mecanismos de reproducción: uno proporcional al crecimiento de los macrófagos infectados, y el otro de tipo logístico debido a las bacterias libres liberadas por los macrófagos. El análisis del modelo muestra diferentes escenarios en los cuales se revela la existencia de bifurcaciones hacia adelante, hacia atrás y bifurcaciones en forma de S, todas trasladadas hacia la izquierda lo cual implica que el parámetro de bifurcación sea menor que uno.